
保种分析
通过G矩阵亲缘关系分析展示群体中任意两个体间的基因组亲缘关系,帮助客户进行群体保种分析。
分析流程

图一
通过G矩阵亲缘关系分析展示群体中任意两个体间的基因组亲缘关系,
方格填充颜色越接近红色表示该值越大,即两个个体亲缘关系越近,
亲缘关系较近的个体会聚类到一起,
且他们所在的单元格颜色更接近红色;
对角线上是每个样本与其本身的亲缘关系值,所以呈现红色。
图二
聚类分析是从一组复杂数据产生一个相当简单的类结构。
通过聚类分析把关系密切的个体聚合到一个小的分类单元,关系相对疏远的个体聚合到一个较大的分类单元,直到把所有样本都聚合完毕。
基因组上的长纯合片段(Runs of homozygosity, ROH)在所有群体中广泛存在。
长的ROH可指示发生在较近期的亲缘关系,这样的片段越多,个体内存在近交的可能性越高。